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  最終修正日

  2020/3/7

 

低分子理論有機化学研究 核内レセプター研究 構造バイオインフォマティクス研究 創薬化学研究

高性能、高機能タンパクモデリング機能解析システムHomology Modeling for HyperChem 史上最強計算化学環境Gaussian Interface for HyperChem 世界初完全自動インターラクティブONIOM法インターフェイス 世界初、化学第一原理のみに基づく究極の革新技術を搭載 完全GUIベース分子2D-3D変換プログラム 比類なき構造ベース創薬支援システム AutoDock Vinaインシリコスクリーニングインターフェイス 世界初、化学第一原理のみに基づく究極の革新技術 有機合成化学者のための論理的ドラッグデザイン MFDD インシリコ創薬受託サービス 受託計算サービス HyperChem取り扱い

Homology Modeling Professional for HyperChem

 

Trajectory Analyzer (トラジェクトリー解析) 

トラジェクトリ−解析モジュール

 

特徴

トラジェクトリー解析プログラムはHyperChem分子動力学計算から得られるスナップショットファイルからエネルギートラジェクトリ、RMSDトラジェクトリをテキスト形式で抽出するとともに、任意の時間あるいは時間範囲における分子座標をHIN(HyperChemフォーマット)、ENT、あるいはPDB形式にいっきに変換できます。これにより、ステップ時間毎での個々の構造を詳細に解析できるようになります。また、HyperChem以外の分子ビューアソフトでのトラジェクトリーのアニメーション化が可能となります。

 

以下は本機能を利用したリガンドエントリーに関する反応座標解析を実施した際のアニメーションです。

分子動力学計算結果のアニメーション化

 

 

新型コロナウイルスに対するコンピュータシミュレーションによる医薬品設計についての分子機能研究所の取り組みを公開中

新型コロナウイルスSARS-CoV-2(2019-nCoV)主要プロテアーゼを阻害する既知医薬品のインシリコスクリーニング(コンピュータシミュレーション)による探索研究を公開

新型コロナウイルスに対する抗体医薬の分子設計に関する研究を公開

 

 

 

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