最終修正日
2025/1/1
リガンド認識メカニズム解析
タンパク-リガンド複合体形成反応座標解析（分子動力学反応座標解析計算）
Homology Modeling for HyperChemはタンパクモデリングのみならず、極めて強力なタンパク機能解析能力を有しています。
その一例として、以下のようなタンパク-リガンド複合体形成反応座標は、理論計算にもよりますが、分子力場計算レベルでは約半日程度で解析できます。
このシミュレーション（分子動力学計算）では複合体形成前のタンパク構造は別種タンパク単体の結晶構造を鋳型にモデリングしたものを使用しています。
以下にシミュレーション（分子動力学計算）で得られた複合体構造を実際の複合体結晶構造と重ね合わせた結果を示します。シミュレーション（分子動力学計算）で得られた複合体のリガンド結合モードおよびタンパクモデルの接触残基のロータマーが極めて正確に再現されています。
ここではこれ以上紹介することができませんが、ここで紹介した例はほんの一例です。Homology Modeling for HyperChemはこのような最高レベルの未踏の研究をも支援できる能力があります。
2005年5月
核内受容体のリガンド認識メカニズム解析についてはこちら
