最終修正日
2024/1/1
書籍
分子モデリング関連
Homology Modeling Reference for HyperChem, 1st ed.
英文
前半37頁までHomology Modeling for HyperChemのユーザーインターフェイスおよび機能の説明がある。
後半62頁までHyperChem上でHomology Modeling for HyperChemを使用して人ロドプシンを例にホモロジーモデリングを実践する。
また、Homology Modeling for HyperChemに備わる強力なツールを用い、レチノール結合タンパクのアポ型（リガンド結合前）とホロ型（リガンド結合後）立体構造を例に、低温分子動力学アニーリングによる構造変化の解析手順を解説する。
目次
推奨最小システム構成
必要なソフトウェア
インストール
TclPro1.2のインストール
Homology Modeling for HyperChemのインストール
ユーザーインターフェイス
全プログラム共通
Estimation of Hydrogen Atoms in Water
Geometry Correction
Homology Modeling
Interface Selection
Protein Superposition
Ramachandran Plot
Restraints
Side Chain Rotamer Modeling
ホモロジーモデリングチュートリアル１
ホモロジーモデリングチュートリアル２
補遺
マニュアル側鎖ロータマーモデリング