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最終修正日 2008年6月5日
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Homology Modeling for HyperChem タンパク-リガンド複合体形成反応座標解析
その一例として、以下のようなタンパク-リガンド複合体形成反応座標は、理論計算にもよりますが、分子力場計算レベルでは約半日程度で解析できます。
このシミュレーションでは複合体形成前のタンパク構造は別種タンパク単体の結晶構造を鋳型にモデリングしたものを使用しています。 以下にシミュレーションで得られた複合体構造を実際の複合体結晶構造と重ね合わせた結果を示します。シミュレーションで得られた複合体のリガンド結合モードおよびタンパクモデルの接触残基のロータマーが極めて正確に再現されています。
最高レベルの研究のため、ここではこれ以上紹介することができませんが、ここで紹介した例はほんの一例であり、さらに多くの成果および多くの科学的発見をすでに保有しています。Homology Modeling for HyperChemはこのような最高レベルの未踏の研究をも支援できる能力があります。
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