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有機合成化学者のための論理的ドラッグデザイン手法の紹介

タンパク・リガンドフレキシブルドッキングプログラム、Docking Study with HyperChem

 

      最終修正日

   2008年6月5日

 

Homology Modeling for HyperChem

高性能、高機能タンパクモデリング機能解析システムHomology Modeling for HyperChem 史上最強計算化学環境Gaussian Interface for HyperChem 世界初完全自動インターラクティブONIOM法インターフェイス 世界初、化学第一原理のみに基づく究極の革新技術を搭載 完全GUIベース分子2D-3D変換プログラム 比類なき構造ベース創薬支援システム 世界初、化学第一原理のみに基づく究極の革新技術

タンパク-リガンド複合体形成反応座標解析

タンパク-リガンド複合体形成反応座標解析Homology Modeling for HyperChemはタンパクモデリングのみならず、極めて強力なタンパク機能解析能力を有しています。

その一例として、以下のようなタンパク-リガンド複合体形成反応座標は、理論計算にもよりますが、分子力場計算レベルでは約半日程度で解析できます。

タンパク−リガンド複合体形成反応座標

 

このシミュレーションでは複合体形成前のタンパク構造は別種タンパク単体の結晶構造を鋳型にモデリングしたものを使用しています。

以下にシミュレーションで得られた複合体構造を実際の複合体結晶構造と重ね合わせた結果を示します。シミュレーションで得られた複合体のリガンド結合モードおよびタンパクモデルの接触残基のロータマーが極めて正確に再現されています。

 

シミュレーション複合体構造と結晶構造の重ね合わせ結果

 

最高レベルの研究のため、ここではこれ以上紹介することができませんが、ここで紹介した例はほんの一例であり、さらに多くの成果および多くの科学的発見をすでに保有しています。Homology Modeling for HyperChemはこのような最高レベルの未踏の研究をも支援できる能力があります。

 

 

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