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最終修正日 2008年8月30日
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Homology Modeling for HyperChem
HyperChem - 洗練された分子モデリング環境 -
卓越した分子モデリング機能 あらゆる分子種を表現可能な平面分子作画システム 自動三次元化、自動水素原子付加、自動力場パラメータ設定機能 アミノ酸、核酸、糖、ポリマーエディタ機能 RMSフィット、オーバーレイ機能 コンフォメーション探索機能 カット＆ペースト機能
網羅的計算化学環境 分子力学計算 MM+、Ambers、Amber2、Amber3、Amber94、Amber96、Amber99、Bio+83、Bio+85、Charmm-19、Charmm-22、Charmm-27、Opls、Custom 半経験分子軌道法 Extended Huckel、CNDO、INDO、MINDO3、MNDO、MNDO/d、AM1、PM3、ZINDO/1、ZINDO/s、TNDO Ab Initio分子軌道法 Hartree-Fock、MP2、CI 密度汎関数法 一点計算、構造最適化 分子動力学計算 Molecular Dynamics、Langevin Dynamics、Monte Carlo 極小化アルゴリズム Steepest Descents、Flecher-Reeves、Polak-Ribiere、Eigenvector Following、Newton-Raphson、Conjugate Directions 振動解析、遷移状態解析、NMR解析、QSAR
豊富なレンダリング機能 選択的表示機能、Customカラー表示 ラベル機能 symbol、name、number、type、charge、spin、mass、chirality、basis set、RMS gradient、residue、sequence、res+seq、bond length、bond order、custom 分子表示 スティック、ボール、ボール＆スティック、CPK、チューブ、ドット表示 分子軌道、静電ポテンシャル、電荷密度、スピン密度表示 2D-3D、メッシュ、Jorgensen-Salem、ライン、フラット、半透明、その他 水素結合、双極子モーメント OpenGL二次構造表示、リボン表示 反応座標、NMRチャート、振動チャート
拡張性 C、C++、Fortran、Tcl/Tk、DDEスクリプタブル
互換性 PDB、ENT、カーテシアン、Z-マトリックス、ISIS、MDL、TRIPOS、ChemDraw
Homology Modeling for HyperChemおよびDocking Study with HyperChemはHyperChemおよびGaussianの機能を余すことなく利用してタンパクモデリング、機能解析、シミュレーション、およびin silico創薬を支援できる構造ベース創薬支援システムです。
* HyperChemはHypercube, Incの登録商標です。 ** GaussianはGaussian, Inc.の登録商標です。 *** 本製品の開発にあたり、Hypercube, Inc.およびGaussian, Inc.の承認済みです。
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